Desde el año de su constitución, 2019, el proyecto Atlas Museo ha sido organizador y coorganizador de diferentes eventos académicos, entre los que son imprescindibles destacar los siguientes:
Seminario de doctorado Arte, imagen, exhibición y representación política, celebrado en la Facultad de Geografía e Historia de la Universidad Complutense de Madrid bajo la dirección de Javier Arnaldo. Celebrado los días 11, 12 y 13 de marzo de 2019.
Jornada El Valle de los Caídos a debate, programada en la Facultad de Geografía e Historia de la Universidad Complutense de Madrid bajo la dirección de Javier Arnaldo y Ángel Llorente. Celebrada el día 10 de abril de 2019.
Congreso internacional Historia de los museos, historia de la museología, programado como III Foro Ibérico de Estudios Museológicos en el Museo Arqueológico Nacional bajo la dirección de Javier Arnaldo y con Alicia Herrero en la subdirección ejecutiva del evento. Celebrado los días 18 y 19 de octubre de 2019.
Seminario internacional Amazing experiences of Cultural Heritage. Percorsi evocativi e immersivi dal museo al paesaggio, programado en colaboración con sendos grupos de investigación de la Université Paris 1, Panthéon Sorbonne y la Alma Mater Studiorum Università di Bologna, en la Universidad de Bolonia, bajo la dirección de Sandra Costa y Dominique Poulot en colaboración con Javier Arnaldo. Celebrado los días 17, 19, 24 y 26 de noviembre de 2020.
Congreso internacional Coordenadas culturales en la museología del presente: en torno a cinco neologismos, programado bajo la dirección de Javier Arnaldo en el Museo Nacional del Prado. Celebrado los días 14 y 15 de octubre de 2021.
Seminario La museología del presente. Polifonías de los relatos museológicos en la transcultura, coordinado por Modesta di Paola en el Centre Pompidou de Málaga. Celebrado el día 19 de septiembre de 2022.
Segundas Jornadas “Patrimonio y ciudad”: ¿Museos para quién? ¿Museos cómo?, Luis Sazatornil Ruiz, Coordinador científico, Ayuntamiento de Santander – Proyecto I+D+i “Atlas Museo” (Universidad Complutense de Madrid / Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades). Santander, 8-10 de septiembre de 2022